Как аптеке работать с НДС на УСН

Аптеки, работающие на УСН, как и другие упрощенцы, с 2025 года стали плательщиками НДС. В статье напомним общие правила работы с НДС на упрощенке, а также остановимся на специфике аптечного бизнеса на УСН.

С 2025 года для аптечных организаций на упрощенке возможны несколько сценариев работы с НДС. Рассмотрим их подробнее.

Аптека на УСН освобождена от НДС

Это аптечные организации, которые работали на упрощенке в 2024 году или переходят на УСН с 01.01.2025, при этом их налоговый доход за 2024 год не превысил 60 млн руб. 

С 2025 такие аптеки освобождаются от обязанностей плательщика НДС (п. 1 ст. 145 НК РФ), а в их деятельности с налоговой точки зрения ничего не меняется. Единственное — придется перепрошить ККТ и обновить бухгалтерскую систему, применяемую при работе с кассовой техникой, так как с введением НДС на УСН обновились форматы фискальных данных (Приказ ФНС от 15.11.2024 № ЕД-7-20/1038@).

Если доход аптеки за 2025 год не превысит 60 млн руб., она будет освобождена от НДС и в 2026 году. Но если ее доход когда-либо превысит 60 млн руб., аптека утратит освобождение с первого числа месяца, следующего за месяцем, в котором случилось превышение (п. 3 Методических рекомендаций по НДС для УСН, утв. письмом ФНС от 17.10.2024 № СД-4-3/11815@). И тогда освобождения не будет и в следующем году.

Отказаться от освобождения по НДС нельзя (письма Минфина от 07.10.2024 № 03-07-11/96800, от 02.10.2024 № 03-07-11/95245).

Аптека на УСН регистрируется в 2025 году

Аптека, начавшая деятельность в 2025 году, с момента регистрации освобождается от обязанностей плательщика НДС (п. 1 ст. 145 НК РФ, п. 4 Методических рекомендаций). Ситуация с налогом на добавленную стоимость здесь аналогична той, что описана в варианте 1.

Не работали с НДС? Поможем выбрать ставку и подготовить декларацию.

Попробовать бесплатно

Аптека применяет пониженные ставки НДС

Если доход аптечной организации за 2024 год превысил 60 млн руб., она может с 01.01.2025 использовать специальные ставки НДС:

Но есть особенность — вычет налога по приобретенным товарам (работам, услугам) при пониженных ставках не применяется (п. 17 Методических рекомендаций).

Сумма НДС к уплате с выручки исчисляется по ставке 5% (7%) от цены товара без НДС (п. 1 ст. 154 НК РФ, п. 13 Методических рекомендаций).

Перейти на специальную ставку можно как с начала года, так и с начала любого налогового периода по НДС — квартала (п. 8 Методических рекомендаций). О выбранной ставке в ФНС сообщать не надо — инспекция узнает о ней из декларации по НДС за период, начиная с которого аптека использует спецставку (п. 7 Методических рекомендаций).

Пониженную ставку применяйте 3 года подряд, кроме следующих ситуаций (п. 9 Методических рекомендаций):

Ситуация 1. По итогам года доход аптеки не превысил 60 млн руб. — тогда она получит освобождение от НДС с начала следующего года.

Ситуация 2. В течение года доход аптеки превысил 250 млн руб., но не превысил 450 млн руб. В этом случае аптека, выбравшая ставку 5%, обязана перейти на ставку 7 процентов с месяца, следующего за месяцем, в котором доход превысил 250 млн руб. Ставка 7% применяется до конца текущего года и в следующем году.

Ситуация 3. В течение года доход аптеки превысил 450 млн руб. Тогда с месяца, в котором случилось превышение 450 млн руб., она утрачивает и право на УСН, и право на пониженную ставку НДС (п. 4 ст. 346.13, п. 8 ст. 164 НК РФ).

Аптека с 2025 года переходит на ставки НДС 20% (10%)

При применении общих ставок налог с выручки исчисляется по ставке 20% (10%) от цены товара без НДС (п. 1 ст. 154 НК РФ, п. 13 Методических рекомендаций).

При этом на общих ставках аптека может заявить вычеты НДС по приобретаемым товарам (работам, услугам).

При продаже товаров по разным ставкам НДС (и 10%, и 20%) нужно вести раздельный учет выручки (п. 1 ст. 153, п. 1 ст. 166 НК РФ). Раздельный учет реализован в системах автоматизации учета, так как ставка НДС по конкретному товару должна быть отражена в чеке ККТ (п. 1 ст. 4.7 Федерального закона от 22.05.2003 № 54-ФЗ «О применении контрольно-кассовой техники…»).

Аптеки, освобожденные от НДС или выбравшие специальную ставку, включают входящий налог в стоимость товаров (работ, услуг). Поэтому упрощенцы с объектом «доходы минус расходы» могут учесть НДС в составе расходов, при условии, что затраты на приобретение товаров (работ, услуг) учитываются для целей УСН (подп. 3, 8 п. 2 ст. 170, п. 1 ст. 346.16 НК РФ).

А вот доход для целей УСН, независимо от того, какие ставки НДС применяет аптека (общие или специальные), всегда очищается от НДС (п. 1 ст. 346.15, п. 1 ст. 248 НК РФ).

Сравним налоговые обязательства двух аптек, уплачивающих НДС на УСН.

Две аптеки работают на УСН «Доходы минус расходы» со ставкой 15%.

Аптека № 1 применяет специальную ставку 5%, аптека № 2 — общие ставки 20% (10%). Каждая за год продала товаров на сумму 100 млн руб. без НДС. 

Аптека № 2 продала товар:

• на сумму 85 млн руб. без НДС — по ставке НДС 10%;

• на сумму 15 млн руб. без НДС — по ставке НДС 20%.

Затраты каждой аптеки на приобретение товара составили 70 млн руб. за вычетом НДС. Из них:

• 59,5 млн руб. (85 млн руб. / 100 млн руб. х 70 млн руб.) — товары со ставкой НДС 10%;

• 10,5 млн руб. (15 млн руб. / 100 млн руб. х 70 млн руб.) — товары со ставкой НДС 20%.

Итого общие затраты каждой аптеки на приобретение товара с НДС составили 78,05 млн руб. (59,5 + 59,5 х 10% + 10,5 + 10,5 х 20%), в том числе НДС 8,05 млн руб.

Прочие затраты каждой аптеки, учитываемые для целей УСН, составили 15 млн руб.

Расчет налоговой нагрузки: 

Несмотря на то, что НДС, исчисленный с реализации товара, при применении общих ставок выше, чем при специальных, для аптеки общие ставки могут быть выгоднее за счет вычетов НДС по приобретенным товарам (работам, услугам).

Использование любых ставок НДС (хоть общих, хоть специальных) не препятствует аптеке применять освобождение от НДС при реализации медицинских изделий в соответствии с подп. 1 п. 2 ст. 149 НК РФ (письмо Минфина от 11.10.2024 № 03-07-11/98762).

Отчитайтесь легко и без ошибок

Удобный сервис для подготовки и сдачи отчетов через интернет.

Сдать отчеты бесплатно

Налоговые обязательства аптеки, применяющей НДС на УСН

Аптека, независимо от того, какую ставку НДС применяет — пониженную или общую, выполняет следующие обязанности (п. 3 ст. 169, п. 1, 5 ст. 174 НК РФ):

• ежеквартально не позднее 25 числа месяца, следующего за отчетным кварталом, сдает декларацию по НДС в электронном виде;

• уплачивает НДС за истекший квартал ежемесячно не позднее 28 числа равными суммами в течение 3 месяцев, следующих за истекшим кварталом;

• ведет книги продаж и покупок. При применении специальных ставок в книге покупок регистрируются вычеты НДС в определенных случаях, например, если покупатель отказался от покупки и вернул ранее внесенный аванс.

Счета-фактуры аптека в большинстве случаев не оформляет, так как их заменяют чеки ККТ (п. 7 ст. 168 НК РФ). В книге продаж надо регистрировать показания фискального накопителя ККТ с кодом вида операции «26» (п. 13 Правил ведения книги продаж, утв. Постановлением Правительства от 26.12.2011 № 1137, письмо Минфина от 02.04.2018 № 03-07-09/21088, приложение к Приказу ФНС от 14.03.2016 № ММВ-7-3/136@).

Сравним особенности работы аптек на УСН в зависимости от варианта обложения НДС: 

Отметим, что подходы к формированию отпускных цен на лекарственные препараты, включенные в перечень жизненно необходимых и важнейших лекарственных препаратов (ЖНВЛП), которые может применять аптека на УСН с 2025 года, приведены в письме ФАС от 28.12.2024 № ТН/122353/24.

Смотрите видео

У нас есть запись вебинара о том, как избежать проблем при работе с НДС на УСН в 2025 году. Рекомендуем посмотреть ее, чтобы вместе с экспертом разобрать нюансы работы с налогом на добавленную стоимость.